Die BOS Foundation hat bereits über 500 Orang-Utans nach erfolgreicher Rehabilitierung ausgewildert. Auswilderungsgebiete sind geschützte Regenwälder, deren Eignung zuvor genauestens geprüft wurde. Studien über das Nahrungsangebot und andere Tierarten sind Voraussetzungen für eine erfolgreiche Auswilderung. Orang-Utans werden nur in Gebiete ausgewildert, in denen es weder wilde Orang-Utan-Populationen noch Menschen gibt, um Nahrungskonkurrenz, Infektionsübertragungen und Wilderei zu vermeiden.
Es werden meist mehrere miteinander befreundete Orang-Utans gleichzeitig am selben Ort ausgewildert, damit sie sich in dem fremden Gebiet gegenseitig unterstützen können. Der beste Zeitpunkt ist kurz nach der Regenzeit, wenn die meisten Bäume Früchte tragen. Die Auswilderung der rehabilitierten Orang-Utans ist eine logistische und finanzielle Herausforderung, denn die Gebiete liegen oft viele Stunden von den Rehabilitierungsstationen entfernt und können oft nur mit dem Helikopter erreicht werden.
Trotz der vielen ermutigenden Erfolge ist die Situation aufgrund der rasanten Zerstörung der Regenwälder sehr problematisch. Die Aufnahmekapazitäten der Auswilderungsgebiete Meratus und Sungai Wain in Ost-Kalimantan sind inzwischen erschöpft. BOS muss neue Gebiete finden. Rund 800 Orang-Utans sollen eines Tages ausgewildert werden.
Die Verhandlungen über neue Auswilderungsgebiete mit der Provinzregierung laufen nur langsam.



Eine alternative Strategie ist der Kauf von Gebieten, in denen die Tiere übergangsweise artgerecht leben können. Auf sechs Flussinseln in der Nähe der Station Nyaru Menteng sind bereits 150 Orang-Utans in geschützten halbwilden Habitaten untergebracht. Der Fluss ist an diesen Stellen zu breit, als dass die Tiere an das andere Ufer gelangen. Die Inseln werden rund jm die Uhr bewacht. Das Nahrungsangebot der Inseln wird durch die tägliche Fütterung auf Plattformen am Ufer ergänzt. Neben diesen Inseln in der Provinz Zentral-Kalimantan bietet auch das Aufforstungsgebiet Samboja Lestari in Ost-Kalimantan zahlreichen Orang-Utans einen natürlichen Lebensraum.